Research
研究
タンパク質の進化、安定性、機能の関係を理解し、より有用な酵素設計につなげることを目標にしています。
Undergraduate thesis
祖先タンパク質復元
相同配列を収集し、アラインメント・系統樹推定を行い、系統群で保存・支持される残基を手掛かりに祖先的な配列特徴を解析しています。
PET分解酵素の改変
BhrPETaseを対象に、安定性や機能の向上を目指した変異候補を設計し、人工遺伝子・変異体の作製と実験評価を進めています。
Computational workflow
BLASTPMAFFTtrimAlFastTreeIQ-TREE 2UFBootPyMOLFoldXAlphaFold
配列検索 → 多重アラインメント → トリミング → 系統樹推定 → 候補変異の選定 → 構造解析という流れで、実験系と接続しながら検討しています。
Experimental work
PCR、制限酵素処理、ライゲーション、DH5αを用いた形質転換、コロニーチェック、ミニプレップ、シーケンス確認、タンパク質発現、SDS-PAGEなどを行っています。
Next step
2027年4月から大学院で、PET分解酵素を中心としたタンパク質の構造・機能研究を継続する予定です。